После трагического уничтожения лунной экспедиции в 1967 году и захвата космического корабля инопланетными силами, Земля оказалась на грани катастрофы. Эти внеземные существа, известные как BETA (Beings of Extra Terrestrial origin), начали массированное вторжение с целью порабощения человечества. Многие страны пали под натиском захватчиков, но Япония, благодаря своему боевому духу и традициям самураев, смогла устоять. Среди тех, кто встал на защиту родины, была юная девушка Юи, последняя представительница древнего рода самураев. Её путь лежал через кровавые битвы и личные испытания, но она не сдавалась.
В этом хаосе войны Юи находит поддержку в лице своей новой подруги Юе, которая становится для неё не только соратницей, но и близким другом. Вместе они сражаются не только за свою жизнь, но и за будущее всего человечества. Однако, судьба распорядилась иначе, и после окончания событий "Muv-Luv Unlimited", главный герой Такеру просыпается в своей комнате, понимая, что его перенесло в прошлое. Не желая мириться с судьбой, он решает помочь профессору Кодзуки завершить проект "Альтернатива IV", чтобы спасти человечество от гибели.
В преддверии выхода второго сезона аниме "Muv-Luv Alternative", который состоится в октябре 2022 года, фанаты с нетерпением ждут возвращения старых героев. Прошло всего год с момента выхода первой части легендарной франшизы, и зрители уже с трепетом ожидают продолжения истории. Будут ли наши герои успешны в своей миссии? Смогут ли они изменить судьбу человечества? Ответы на эти вопросы ждут нас в новом сезоне, который обещает быть не менее захватывающим и драматичным, чем предыдущие.